研究报告

基于SSR标记的苔草种质遗传多样性分析  

刘凌云1 , 范希峰2 , 滕珂2 , 韩朝2 , 温海峰2 , 张辉2 , 滕文军2 , 常智慧1* , 武菊英2*
1 北京林业大学草业与草原学院, 北京, 100083; 2 北京草业与环境研究发展中心, 北京, 100097
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 26 篇   
收稿日期: 2019年11月27日    接受日期: 2020年01月06日    发表日期: 2021年03月23日
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摘要
苔草属(Carex L.)植物为莎草科多年生草本,在园林绿化、畜牧业生产、生态修复等方面发挥着越来越重要的作用。为了了解新西兰苔草品种间的遗传多样性及与国内苔草的地域差异,对其进行分子标记分析。本研究利用筛选得到的 10 对 SSR 引物对 12 份苔草材料(包括 10 份新西兰引进品种)进行遗传多样性分析,结合聚类分析等揭示苔草材料之间的遗传多样性。结果显示,10 对 SSR 引物最终扩增出 91 条多态性条带,据此建立的指纹图谱显示 Ctcp016 引物可以一次性鉴别 12 份苔草样品;多态性比率为 97.8%,平均每条引物扩增出 8.27 条,多态性信息含量(PIC)在 0.140~0.260 之间,平均多态性信息含量为 0.220,平均遗传距离值为 0.428;12 份参试苔草资源的观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、基因多样性指数(H)以及 Shannon 信息指数(I)平均值分别为 1.976、1.350、0.226、0.368,表明各苔草样品之间的遗传多样性处于较高水平;非加权组平均(UPGMA)聚类系统发生树在遗传距离为 0.428 时可将 12 份苔草分为 3 类,地域对苔草遗传信息无明显影响。本研究表明利用 SSR 标记可以有效地对苔草遗传多样性及群体结构进行分析,并可构建苔草遗传图谱,为以后的研究提供丰富的标记来源,有助于推动苔草分子标记辅助育种工作,为进一步开发利用苔草资源提供帮助。
关键词
苔草属; SSR 分子标记;;遗传多样性;聚类分析; DNA 指纹图谱

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《分子植物育种》印刷版
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